Prende il nome dalla famiglia Jubanico che la fondò del X secolo ma deve la sua forma attuale alla ricostruzione della seconda metà del Seicento. La facciata, uno degli elementi principali della chiesa, venne realizzata da Giuseppe Sardi (1680-83) come monumento celebrativo del capitano da mar Antonio Barbarigo, raffigurato al centro circondato dalle Virtù e con le principali città dove si svolse la sua carriera nel basamento. La statue nelle nicchie, infine, raffigurano i suoi fratelli.