Ospitato all'interno del Palazzo Arcivescovile, raccoglie numerose opere tra cui marmi, dipinti e statue provenienti dalla Cattedrale e da altre chiese della città, qui trasferite e custodite durante la Seconda Guerra Mondiale. Al pianterreno si trovano affreschi del XV secolo; l'opera di maggiore interesse è La Madonna della Perla, del 1171, salvata dalla chiesa scomparsa di San Niccolò Reale. Nella Sala Novelli trovano posto le opere di Pietro Novelli (1603-47), famoso pittore siciliano che lavorò alla corte di Filippo IV di  Spagna.