La grande ancona (o polittico) che fa da quinta all’altare della basilica è opera di Jacobello e Pierpaolo della Masegne. Essa si presenta come una grande struttura marmorea divisa in scomparti, conclusa in alto da slanciate guglie che si allungano verso l’alto, di gusto squisitamente gotico. La parte inferiore ospita le statue dei profeti e dei discepoli, al centro delle quali viene rappresentata l’incoronazione la Vergine e l’Eterno Padre. La predella (parte inferiore del polittico), suddivisa in scoparti quadrangolari, narra episodi della vita di san Francesco.