La chiesa fu iniziata nel 1489 su progetto di Bartolomeo Bon ma venne radicalmente ristrutturata nel 1725 da Giovanni Scalfarotto che modificò la navata conservando, però, le cappelle absidali. Il rifacimento della facciata venne concluso solo nel 1771 da Bernardino Maccaruzzi il cui progetto si ispirò alle forme dell’attigua Scuola di San Rocco, titolare della chiesa. In alto il rilievo con San Rocco che assiste gli infermi è di Giovanni Maria Morlaiter.