Da alcuni anni è purtroppo esposto nel museo della basilica, ma sin dalla sua realizzazione, voluta da Niccolò IV, era rimasto nella navata destra. Attorno alla “grotta della Natività”, che custodiva le reliquie della mangiatoia, Sisto V aveva concepito la sua Cappella Sistina, progettata da Domenico Fontana. È il presepe più antico della storia dell’arte, realizzato dal grande Arnolfo circa 70 anni dopo l’invenzione della sua rappresentazione, che la tradizione attribuisce a san Francesco d’Assisi a Greccio (1223).