Di fianco all'abside del transetto sinistro si trova la Cappella di Santa Caterina, opera di Antonio da Lonate (che la costruì su ispirazione delle opere del Bramante), caratterizzata da una oianta quadrata e da cupola entro tiburio. L’affresco sull’altare con scene del "Martirio di santa Caterina d’Alessandria" sono opera di Bernardino Lanino. Sullo sfondo della scena centrale, si intravedono i ritratti del pittore, del suo maestro Gaudenzio Ferrari e del condiscepolo G. B. Della Cerva.