Il transetto dell’oratorio è stato definito un museo della storia dell'arte genovese del '600, per le tele realizzate dai maggiori artisti della città che illustrano la biografia del santo e i suoi miracoli. Nel "San Giacomo che abbatte i Mori" del Grechetto e nel "San Giacomo apre le porte di Coimbra a re Ferdinando” di G.B. Carlone, in particolare, viene esaltato il ruolo del santo nella Reconquista della Spagna da parte dei  re cattolici contro i mori,  opera a cui  anche i genovesi avevano dato il loro contributo d’armi.