Il nome della chiesa si riferisce alla divisione, avvenuta nel XVI secolo, tra i francescani conventuali e gli osservanti: questi ultimi, infatti, non portavano le scarpe. Essa fu costruita nel XII secolo, su un terreno di proprietà della famiglia Guarini e venne poi rinnovata tra il 1699 e il 1714. L'assenza di un prospetto esterno riccamente decorato, come la maggior parte delle chiese leccesi, le ha conferito il soprannome di “chiesa senza facciata”.  Si racconta che nel 1222 il san Francesco, diretto in Terra Santa, si sia fermato qui e abbia lasciato come dono un suo sandalo. Attualmente, la chiesa, dismessa, funge da spazio espositivo e auditorium.